Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CipcQ8R0W1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CipcQ8R0W1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CipcQ8R0W1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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