Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms