Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cdk5rap2Q8K389 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk5rap2Q8K389 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk5rap2Q8K389 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms