Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssh3Q8K330 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms