Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sde2Q8K1J5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sde2Q8K1J5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sde2Q8K1J5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sde2Q8K1J5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms