Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh3Q8K1E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alkbh3Q8K1E6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms