Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34c1Q8K193 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c1Q8K193 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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