Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip10Q8CJ53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip10Q8CJ53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip10Q8CJ53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip10Q8CJ53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms