Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms