Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms