Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcinQ8CDE2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CcinQ8CDE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcinQ8CDE2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcinQ8CDE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CcinQ8CDE2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcinQ8CDE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcinQ8CDE2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms