Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lancl3Q8CD19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lancl3Q8CD19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lancl3Q8CD19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms