Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf20l1Q8CCJ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf20l1Q8CCJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf20l1Q8CCJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms