Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb2Q8CC27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms