Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC12

Cdan1, Codanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdan1Q8CC12 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdan1Q8CC12 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdan1Q8CC12 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdan1Q8CC12 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdan1Q8CC12 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms