Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Alx1Q8C8B0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alx1Q8C8B0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alx1Q8C8B0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms