Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc90bQ8C3X2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms