Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zhx3Q8C0Q2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zhx3Q8C0Q2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms