Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim47Q8C0E3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim47Q8C0E3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim47Q8C0E3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms