Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim35Q8C006 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim35Q8C006 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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