Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp2Q8BX07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms