Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330017A01RikQ8BU47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330017A01RikQ8BU47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms