Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4aQ8BU40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4aQ8BU40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrp4aQ8BU40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms