Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap20Q8BTU1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap20Q8BTU1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap20Q8BTU1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms