Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6820408C15RikQ8BJX2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
6820408C15RikQ8BJX2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
6820408C15RikQ8BJX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms