Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe23Q8BGW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe23Q8BGW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms