Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4dQ8BGV9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4dQ8BGV9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms