Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AW551984Q8BGF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms