Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npas4Q8BGD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npas4Q8BGD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms