Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm2Q8BGA3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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