Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim65Q8BFW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim65Q8BFW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms