Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc50Q810U5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc50Q810U5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms