Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx32Q80ZJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx32Q80ZJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx32Q80ZJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms