Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl29Q80T74 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms