Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcph1Q7TT79 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcph1Q7TT79 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms