Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc3Q7TQ69 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmc3Q7TQ69 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmc3Q7TQ69 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms