Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim17Q7TPM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms