Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mindy1Q76LS9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy1Q76LS9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy1Q76LS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms