Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2r2Q6ZWZ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.6 ms