Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spcs3Q6ZWQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spcs3Q6ZWQ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spcs3Q6ZWQ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms