Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssx9Q6XAS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssx9Q6XAS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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