Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casc1Q6TDU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casc1Q6TDU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casc1Q6TDU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms