Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx4Q6RUU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx4Q6RUU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx4Q6RUU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms