Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med16Q6PGF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med16Q6PGF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med16Q6PGF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms