Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasa4Q6PFQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasa4Q6PFQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms