Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trak1Q6PD31 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trak1Q6PD31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trak1Q6PD31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trak1Q6PD31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trak1Q6PD31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms