Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Papd7Q6PB75 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Papd7Q6PB75 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Papd7Q6PB75 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms