Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnpQ6P8I4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnpQ6P8I4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnpQ6P8I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnpQ6P8I4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnpQ6P8I4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnpQ6P8I4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnpQ6P8I4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnpQ6P8I4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.8 ms