Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrig3Q6P1C6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig3Q6P1C6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrig3Q6P1C6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms