Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3bQ6NWW9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms